教皇ロドリゴ・ボルジアの息子。
法学を学び、わずか18歳で枢機卿に上りつめた。
また、大胆不敵自信家の闘士で、テンプル騎士団を率いる軍人でもある。
政治、軍事、外交、ありとあらゆるものに才能を発揮しているチェーザレは、
ロドリゴに非常に信頼されており、
ロドリゴ復活の背景にもチェーザレの力がある。

モンテリジョーニに攻め入ったチェーザレは、
アサシンたちに大きなダメージを与えて、エツィオにも傷を負わせる。
果たして、エツィオは彼を止めることができるだろうか……。