若くしてアサシン教団の師範にまで
上りつめたアルタイルだったが、
テンプル騎士団の罠によって
地位を失ってしまう。
大きな陰謀に気づいた彼は、
自らの信条を貫くために戦いを挑んでいく。

フィレンツェに住む
貴族の息子 エツィオ・アウディトーレ。
ある事件をきっかけに一家が没落し、
復讐を誓い暗殺者となる。
その体内にはアサシンの血が
受け継がれている。